El CEPHCIS ofrece cursos de maya, español, francés, italiano, inglés, japonés, alemán y lengua de señas mexicana (LSM). Es promotor del Programa de Inmersión al Español desde el 2011, por el que recibe a personas de diferentes países que se benefician del aprendizaje del español y del conocimiento de la riqueza cultural y natural de Mérida y del estado de Yucatán.